Ważnym elementem naukowym, w skali międzynarodowej, świadczącym o unikatowości badań prowadzonych przez pracowników Obserwatorium w Lamkówku, również w oparciu o dane GNSS zarejestrowane w Obserwatorium, są badania dynamiki jonosfery i jej wpływu na wyniki wyznaczeń pozycji techniką GNSS. Zostały one rozpoczęte w 1995 roku. Są one obecnie prowadzone w ścisłej współpracy z Politechniką w Barcelonie – , Chińska Akademia Nauk – , Uniwersytet w Bath oraz Uniwersytetem w Wuhan.
Ważnym efektem współpracy jest opracowanie własnych oryginalnych algorytmów, służących do wyznaczania bezwzględnych wartości TEC oraz opóźnień aparaturowych, a także do oddzielenia zmian TEC w czasie od zmian w przestrzeni. W ostatnich latach na szczególną uwagę zasługuje opracowanie algorytmów umożliwiających badanie zmian w jonosferze za pomocą różnych technik: GNSS, systemu FORMOSAT/COSMIC, pomiarów in-situ z satelity DEMETER, SWARM, sieci naziemnych jonosond czy radioteleskopu LOFAR. Do najbardziej wartościowych wyników naukowych należy zaliczyć:
- opracowanie metodyki badania zmian całkowitej zawartości elektronów w okresie silnych burz geomagnetycznych z wysoką rozdzielczością czasową (rzędu 5 minut) i przestrzenną (rzędu 150-250 km),
- opracowanie metodyki badania struktury jonosfery na średnich i wysokich szerokościach geograficznych, w okresie silnych burz geomagnetycznych z wysoką rozdzielczością czasową i przestrzenną,
- opracowanie metodyki badania średnio i wielkoskalowych nieregularności w jonosferze na wysokich szerokościach geomagnetycznych w zależności od intensywności fluktuacji TEC (słabe, średnie oraz wysokie) oraz pory dnia lub sezonu roku dla okresu maksymalnej aktywności słonecznej,
- opracowanie metodyki badań scyntylacji sygnałów satelitarnych w oparciu o permanentne obserwacje GNSS ,
- opracowanie empirycznego modelu położenia rowu jonosferycznego (ionospheric trough) na średnich szerokościach geomagnetycznych nad Europą dla pełnego cyklu aktywności słonecznej w oparciu o obserwacje z różnych technik satelitarnych (GNSS, FORMOSAT/COSMIC, DEMETER, SWARM, LOFAR),
- dokonanie doboru optymalnej metody, opartej na teorii procesów stochastycznych, do krótkookresowej predykcji wartości TEC dla okresów zaburzonej jonosfery,
- zastosowanie pomiarów GNNS, FORMOSAT/COSMIC, satelity DEMETER, SWARM, LOFAR do trójwymiarowej tomografii jonosfery dla jej stanów spokojnych i zaburzonych.